王理，江苏南通人，数字医学团队PI，教授、博士生导师
学科专业： 生物医学信息学
研究方向： 智慧医疗，医疗大数据，医疗人工智能，肿瘤信息学
实验室位置：南通产业研究院4号楼14楼
联系方式： 15951318963
49344920（QQ同微信）
Email地址: wangli@ntu.edu.cn
学习经历：
1999-09~2003-06 南京师范大学学士，教育技术
2003-09~2006-06 南京师范大学硕士，教育技术
2008-04~2011-03 日本德岛大学博士，智能信息系统工程（自然语言处理）
主要工作经历与任职情况：
2021.07-至今 南通大学，智能信息技术中心智慧医疗方向PI，教授，博士生导师
2019.08-2021.06 南通大学，智能信息技术中心智慧医疗方向PI，校聘教授，博士生导师
2012.08-2019.07 南通大学, 医学院医学信息学系,副教授，硕士生导师
2018.06-2019.07 南京医科大学，生物医学工程与信息学院医学信息工程系，特聘教授
2016.08-2017.02 美国德克萨斯大学休斯顿健康科学中心, 生物信息学院，高级访问学者
2012.06-2014.06 南通大学附属医院南京医科大学，博士后
2011.06-2012.07 南通大学, 医学院医学信息学系，讲师
主要研究领域及兴趣：
· 基于图表示学习的医学知识搜索引擎
· 益赛普治疗类风湿关节炎及强直性脊柱炎真实世界研究
· 5G+区域急救中心建设，工业与信息化部5G+医疗健康试点项目
· 基于医学自然语言处理的靶向药物活性与毒性智能化筛查
· 面向Wnt通路的Protac小分子药物生成模型
代表性论文：
[1]Jingsong Shao; Qineng Gong; Zeyu Yin; Wenjie Pan; Sanjeevi Pandiyan; Li Wang#; S2DV: converting SMILES to a drug vector for predicting the activity of anti-HBV small molecules, Briefings in Bioinformatics, 2022, doi:10.1093/bib/bbab593, (IF11.6),TOP JCR1区
[2]Li Wang, Jiang L, Pan D, Wang Q, Yin Z, Kang Z, Tian H, Geng X, Shao J, Pan W, Yin J, Fang L, Wang Y, Zhang W, Li Z, Zheng J, Hu W, Pan Y, Yu D, Guo S, Lu W, Li Q, Zhou Y, Xu H. Novel Approach by Natural Language Processing for COVID-19 Knowledge DiscoveryBiomedical Journal. 2022, DOI: 10.1016/j.bj.2022.03.011. (IF4.91)JCR2区
[3]Xinjian Song, Feng Gu, Xiude Wang,Songhua Ma and Li Wang#，Interpretable Recognition for Dementia Using Brain Images, Frontiers in Neuroscience, doi:10.3389/fnins.2021.748689 (IF 4.677) JCR2区
[4]Heming Bai, Lei Jiang, Ting Li, Chong Liu, Xiaoxia Zuo, Yi Liu, Shaoxian Hu, Linyun Sun, Miaojia Zhang, Jin Lin, Weiguo Xiao, Qingwen Wang, Dongbao Zhao, Huaxiang Wu, Xiaodan Kong, Wenkang Gao, Wanxin Hou, Myeongsu Seong, Yuanpeng Zhang, Fangfang Chen, Sheng Chen, Xin Wu, Chunde Bao#, Li Wang#, Huji Xu#. Acute effects of air pollution on lupus nephritis in patients with systemic lupus erythematosus: A multicenter panel study in China. Environmental Research, 2021, 195, DOI:10.1016/j.jes.2021.01.022.( IF 6.498)JCR1区
[5]Heming Bai, Wenkang Gao, Yuanpeng Zhang, Li Wang#. Assessment of health benefit of PM2.5 reduction during COVID-19 lockdown in China and separating contributions from anthropogenic emissions and meteorology. Journal of Environmental Sciences, 2021, DOI:10.1016/j.envres.2021.110875.(IF5.566)JCR1区
[6]Yuanpeng Zhang, Ziyuan Zhou, Heming Bai, Wei Liu and Li Wang#, Seizure Classification from EEG Signals Using an Online Selective Transfer TSK Fuzzy Classifier with Joint Distribution Adaption and Manifold Regularization, Frontiers in Neuroscience,doi:10.3389/fnins.2020.00496 (IF4.677) JCR2区
[7] Li Wang, Qinghua Wang,Heming Bai,Cong Liu,Wei Liu,Yuanpeng Zhang,Lei Jiang, Huji Xu,
Kai Wang and Yunyun Zhou.EHR2Vec: representation learning of medical concepts from temporal patterns of clinical notes based on self-attention mechanism, Frontiers in Genetics, DOI: 10.3389/fgene.2020.00630 (IF4.599)JCR2区
[8]Li Wang; Wenjie Pan; QingHua Wang; Heming Bai; Wei Liu; Lei Jiang; Yuanpeng Zhang; A Modified Skip-Gram Algorithm for Extracting Drug-Drug Interactions from AERS Reports, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2020, doi:10.1155/2020/1747413 (IF2.24)JCR4区
[9]Li Wang, Min Yao, Wenjie Zheng, Miao Fang, Mengna Wu, Jianying Sun, Zhizhen Dong, Dengfu Yao. Insulin-like Growth Factor I Receptor: A Novel Target for Hepatocellular Carcinoma Gene Therapy. Mini-Rev Med Chem. 2019; 19(4): 272-280 (IF2.842)JCR3区
[10]Wang L, Yao M, Fang M, Zheng WJ, Dong ZZ, Pan LH, Zhang HJ, Yao DF. Expression of hepatic Wnt5a and its clinicopathological features in patients with hepatocellular carcinoma. Hepatobiliary Pancreat Dis Int. 2018 Jun;17(3):227-232. (IF1.500 )JCR 4区
[12]Wang L, Pan LH, Yao M, Cai Y, Dong ZZ, Yao DF. Expression of oncofetal antigen glypican-3 associates significantly with poor prognosis in HBV-related hepatocellular carcinoma. Oncotarget.2016 Jun 7; 7(27): 42150-42158. (IF5.168) JCR2区
主持横向产学研课题
苏州赫博特医疗信息科技有限公司，临床电子病历中命名实体的抽取技术改进，2017/10-2018/10
参与开发Plato医学自然语言处理平台，实现将电子病例中大量存在的由自由文本描述的主诉、既往史、现病史、检验、检查、入院记录、出院小结、病程等非结构化信息，转化成统一化、规范化、结构化编码的数据，并且对接到OMOP临床科研通用数据模型，解决非结构化数据转化为标准的结构化数据难题，打破文本数据和临床科研分析之间的屏障。目前，平台中包含多种赫博特拥有完全自主知识产权的自然语言处理技术和功能模块，使用者可以根据文本的类型自由配置我们提供的算法来生成各种管道模型，能快速的实现文本的精准提取，准确率可达到90%以上。
神州数码医疗科技股份有限公司，肿瘤大数据处理分析与应用，2017/12-2018/11
收集肺癌、食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌等8 种常见等恶性肿瘤的临床电子病历文本，结合病理科和检验科以及医嘱文本，建设标准化和可共享的病历文本集成平台；利用自然语言处理和电子病历信息抽取等关键技术进行大规模数据抽取。实现肿瘤大数据高性能处理分析与具体应用。
整合SNOMETCT，CHPO，LOINC等多个术语系统，开发针对肺癌、食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌等8 种常见等恶性肿瘤的专用术语体系，协助进行电子病例的结构化和数据提取。对癌症知识，采用本体技术进行研究和分析，构建癌症本体模型。协助建立肿瘤医疗随访平台，临床决策支持平台。优化肿瘤精准医学大数据存储技术及传输安全性。
南通市第二人民医院，智能康复大数据分析与应用，2021.01-2023.12
指导收治常见多种康复医疗涉及到的疾病相关临床电子病历文本，结合病理科和检验科以及医嘱文本，建设标准化和可共享的患者相关数据集成平台，利用自然语言处理和电子病历信息抽取等关键技术进行大规模数据抽取，从而实现康复医疗大数据高性能处理分析与具体应用。
主持或参加纵向项目（课题）及人才计划项目情况
国家自然科学基金，面上项目(81873915)，面向信息交互的中国临床标准药物知识库构建与评测研究，2018-2022，主持
为了使得不同系统之间能够有效地无歧义地交换药品相关信息，项目通过借鉴国外成熟的药物信息模型，针对中国临床药物的描述特点，构建中国临床标准药物知识库。研究从四大数据源搜集药物的基本信息，然后将自然语言处理技术和领域专家审查相结合，实现药物属性提取，标准化，生成不同规格级别的药物名称描述，从多角度多层次构成药物知识库。目前药物知识库包含19,639种临床药物，250,267条药物概念以及2,602,760条药物关系。我们将药物知识库应用于江苏省人民医院院内药品与药物知识库进行映射、转换成通用数据模型中标准概念，用于后期药物统计与数据挖掘。实验结果表明，药物知识库可以准确描述规范化的药物信息，覆盖大部分药物资源，展示其促进中国各种电子病历系统之间药物信息互操作性的能力。
科技部国家重点研发计划，基于人工智能的临床辅助决策支持新型服务模式解决方案(2018YFC0116902)，在研,2018-2020，子课题负责人
建立临床文本中辅助决策支持概念的标准化映射，将临床指南转化为临床知识库体系；基于多种决策支持模型的新一代人工智能技术实现，搭建满足就医闭环流程需求临床辅助决策专家系统大数据云技术平台。研究临床医学文本的存储、管理与分析智能化流程，尤其是解决实现多中心临床数据的高速传输、云端管理与分析完整流程；在统一数据标准化框架下，开发临床辅助决策专家系统；研发新一代人工智能计算框架、算法与模型，实现知识的排列，索引与展现；分析满足智能辅助分诊、问诊、诊断和治疗的多致病性因素的分布规律。
代表性研究成果和学术奖励
(1)王理(3/8), 新型癌胚型特异标志和HBV变异对肝癌监测和早期预警价值, 中华预防医学会，中华预防医学会科学技术奖三等奖, 科技进步, 其他, 2017.11
(姚登福; 曹广文; 王理; 张津玮; 陈建荣; 姚敏; 董志珍; 吴玮) (科研奖励)
(2)王理(2/7), 肝癌分泌型聚集素异常表达及其靶向干预的临床价值, 南通市人民政府，南通市科学技术进步奖三等奖, 科技进步, 其他, 2017.5
(郑文杰; 王理; 陈飞; 赛文莉; 钱琦; 姚登福; 张海健) (科研奖励)
(3)王理(4/5), 流感病毒感染诱发多脏器损伤及线粒体能量代谢障碍机制, 江苏省教育厅，江苏省教育科学研究成果(高校科学技术研究类)科技进步奖二等奖,科技进步, 其他, 201(姚登兵; 姚敏; 蔡敏; 王理; 姚登福) (科研奖励)
(4)王理(4/7), HBV相关肝癌发病机制及特异分子监测技术研发与应用, 江苏省人民政府，江苏省科学技术奖三等奖, 科技进步, 其他, 2015
(姚登福; 曹广文; 王进科; 王理; 张津玮; 姚敏; 朱建伟) (科研奖励)
(5)王理(2/7), 肝癌IGF-I受体异常表达及其转录干预的临床价值研究, 南通市人民政府，南通市科学技术进步奖二等奖, 科技进步, 其他, 2015.12.21
(董志珍; 王理; 姚登福; 李敏; 姚宁华; 严晓娣; 吴玮) (科研奖励)
(6)王理(4/9), 肝细胞恶性转化特异标志筛选及早期预警价值研究, 江苏省预防医学会，江苏预防医学科技奖一等奖, 科技进步, 其他,2015.2.27
(姚登福; 王进科; 龚伟达; 王理; 张津玮; 顾红兵; 徐水珠; 朱建伟; 陈钟)
(7)王理，姜磊，黄勋，一种基于神经网络语言模型的药物潜在不良反应发现方法2019.05.23,201910039475.4 实审（专利）
(8)王理，姜磊，黄勋，一种基于注意力机制的医疗实体向量转化方法，2019.07.17,201910644003.1 实审（专利）
(9)王理; 邵劲松; 蓝俊; 施维; 薛均; 张远鹏; 董建成; 姚敏; 姚登福, 一种突发公共卫生事件互联网文本抽取方法, 2015.12.23, 中国, CN201510964759.6 (专利)
(10)王理; 蓝俊; 邵劲松; 施维; 薛均; 张远鹏; 董建成; 姚敏; 姚登福, 一种公共卫生事件预警知识库的构建方法, 2015.12.22, 中国, CN201510961363.6 (专利)
(11)王理; 张远鹏; 钱旦敏; 董建成; 姚敏; 邵劲松; 蓝俊,一种领域知识库属性扩展的方法, 2015.1.8, 中国, CN201510010013.1 (专利，已授权)
(12)王理; 张远鹏; 钱旦敏; 姚敏; 邵劲松; 蓝俊; 董建成,一种公共卫生突发事件领域知识库的构方
法, 2015.1.8, 中国, CN201510009769.4 (专利)
招生招聘：
本实验室主要利用自然语言处理技术，机器学习和深度学习等手段，研究基于临床数据的疾病决策支持系统，应用于医院数据管理，医生辅助诊断以及智慧医疗健康系统。热情欢迎对智慧医疗有兴趣的学生加入。每年拟接收10名本科生，8名硕士生，4名博士生和2名博士后。